自養(yǎng)菌（無機營養(yǎng)型）；能直接利用無機物如空氣中二氧化碳及無機鹽類作為營養(yǎng)物來源，合成細(xì)胞所需要的碳源微生物，叫自養(yǎng)菌。自養(yǎng)菌又分光能自養(yǎng)菌與化學(xué)能自養(yǎng)菌。如藻類和含葉綠素的****利用葉綠素吸收光能，從二氧化碳合成所需化合物的微生物叫光能自養(yǎng)菌。而化學(xué)能自養(yǎng)菌能氧化一定得無機化合物，利用產(chǎn)生的化學(xué)能還原二氧化碳合成有機碳化物，這類****如硝化****、鐵****、硫****等。自然界中的化學(xué)能營養(yǎng)菌分布較光能營養(yǎng)菌普遍，對于自然界中氮、硫、鐵等物質(zhì)轉(zhuǎn)化有很大作用。
異養(yǎng)菌：利用環(huán)境中的有機物進(jìn)行氧化發(fā)酵得到細(xì)胞所需營養(yǎng)物的菌種叫異養(yǎng)菌。其可以是不含葉綠素的。其中有些****生活在動物尸體上吸收養(yǎng)料，這種營養(yǎng)方式叫腐生；有些****生活在活動的動物上吸收養(yǎng)料這叫寄生。